Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HTRA2O43464 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTRA2O43464 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms