Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF3O43395 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms