Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTSS1O43312 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms