Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRXO43186 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRXO43186 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRXO43186 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRXO43186 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRXO43186 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRXO43186 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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