Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF5O14894 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF5O14894 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF5O14894 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF5O14894 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF5O14894 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF5O14894 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF5O14894 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF5O14894 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF5O14894 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF5O14894 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM4SF5O14894 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM4SF5O14894 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM4SF5O14894 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TM4SF5O14894 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF5O14894 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF5O14894 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF5O14894 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF5O14894 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF5O14894 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF5O14894 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TM4SF5O14894 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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