Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGRF2O14827 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RASGRF2O14827 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASGRF2O14827 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms