Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPEO14579 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPEO14579 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPEO14579 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPEO14579 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPEO14579 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPEO14579 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPEO14579 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPEO14579 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPEO14579 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPEO14579 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPEO14579 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPEO14579 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPEO14579 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPEO14579 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPEO14579 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPEO14579 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPEO14579 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPEO14579 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPEO14579 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPEO14579 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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