Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOCS3O14543 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms