Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS1O00470 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS1O00470 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms