Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP1O00294 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP1O00294 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP1O00294 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP1O00294 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP1O00294 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP1O00294 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP1O00294 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP1O00294 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP1O00294 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP1O00294 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP1O00294 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP1O00294 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP1O00294 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP1O00294 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP1O00294 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP1O00294 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP1O00294 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP1O00294 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP1O00294 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP1O00294 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TULP1O00294 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TULP1O00294 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TULP1O00294 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TULP1O00294 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TULP1O00294 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP1O00294 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms