Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFXAPO00287 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFXAPO00287 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFXAPO00287 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms