Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAPO00193 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAPO00193 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAPO00193 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAPO00193 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAPO00193 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAPO00193 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAPO00193 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAPO00193 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAPO00193 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAPO00193 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAPO00193 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAPO00193 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAPO00193 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAPO00193 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAPO00193 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAPO00193 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAPO00193 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAPO00193 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms