Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGPSO00116 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGPSO00116 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGPSO00116 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPSO00116 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGPSO00116 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGPSO00116 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGPSO00116 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGPSO00116 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGPSO00116 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGPSO00116 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGPSO00116 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGPSO00116 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGPSO00116 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGPSO00116 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGPSO00116 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGPSO00116 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGPSO00116 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGPSO00116 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPSO00116 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPSO00116 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPSO00116 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPSO00116 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPSO00116 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPSO00116 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPSO00116 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPSO00116 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPSO00116 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPSO00116 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPSO00116 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPSO00116 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPSO00116 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPSO00116 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPSO00116 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPSO00116 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPSO00116 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPSO00116 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPSO00116 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPSO00116 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPSO00116 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms