Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3QKU1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3QKU1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3QKU1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3QKU1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3QKU1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QKU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3QKU1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QKU1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QKU1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QKU1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QKU1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QKU1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QKU1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QKU1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QKU1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
J3QKU1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
J3QKU1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
J3QKU1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
J3QKU1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
J3QKU1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
J3QKU1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
J3QKU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
J3QKU1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QKU1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QKU1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QKU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QKU1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3QKU1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3QKU1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3QKU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
J3QKU1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3QKU1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
J3QKU1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3QKU1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms