Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C1W4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C1W4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
H7C1W4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C1W4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C1W4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H7C1W4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H7C1W4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
H7C1W4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
H7C1W4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H7C1W4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H7C1W4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C1W4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C1W4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C1W4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C1W4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C1W4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C1W4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C1W4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C1W4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C1W4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C1W4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C1W4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C1W4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C1W4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C1W4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C1W4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
H7C1W4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
H7C1W4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
H7C1W4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
H7C1W4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
H7C1W4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
H7C1W4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
H7C1W4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
H7C1W4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
H7C1W4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
H7C1W4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H7C1W4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H7C1W4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H7C1W4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H7C1W4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
H7C1W4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
H7C1W4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
H7C1W4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H7C1W4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H7C1W4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H7C1W4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms