Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BRB1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BRB1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BRB1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BRB1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BRB1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BRB1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BRB1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3BRB1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3BRB1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3BRB1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BRB1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BRB1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BRB1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BRB1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BRB1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BRB1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BRB1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BRB1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3BRB1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BRB1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BRB1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BRB1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BRB1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BRB1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3BRB1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
H3BRB1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
H3BRB1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BRB1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BRB1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BRB1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BRB1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BRB1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BRB1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BRB1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BRB1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BRB1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms