Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NACAE9PAV3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms