Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERVV-1B6SEH8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERVV-1B6SEH8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms