Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DEV8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DEV8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DEV8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
B4DEV8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DEV8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DEV8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B4DEV8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B4DEV8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms