Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB1P1B2RPK0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms