Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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