Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YJEFN3A6XGL0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YJEFN3A6XGL0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YJEFN3A6XGL0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms