Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC169A6NNP5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC169A6NNP5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC169A6NNP5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms