Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RGPD3A6NKT7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD3A6NKT7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms