Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD8B2A6NJW9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms