Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SERINC4A6NH21 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERINC4A6NH21 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms