Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSDA5PKW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSDA5PKW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms