Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEFA5A3E0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEFA5A3E0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms