Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EME2A4GXA9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EME2A4GXA9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms