Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMX2A2RU54 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms