Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A087WWV3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WWV3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087WWV3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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