Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ELP4-212ENST00000638764 2456 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TTI2-204ENST00000520636 1588 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 THEGL-202ENST00000512175 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC097652.1-201ENST00000511385 2114 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MIR6770-3-201ENST00000616362 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MIR6770-2-201ENST00000618304 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MIR6770-1-201ENST00000622248 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ANKRD30BP2-202ENST00000447861 3260 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FO681491.1-201ENST00000623586 3260 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC122688.3-201ENST00000623804 3467 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CFAP157-202ENST00000373295 1721 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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