Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 KRT8P46-201ENST00000512037 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL445989.1-201ENST00000611641 1436 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 HIST1H1E-201ENST00000304218 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL021068.1-201ENST00000392097 911 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RN7SL265P-201ENST00000486808 300 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ENO1P2-201ENST00000557166 974 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 C17orf62-210ENST00000577732 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC125494.1-202ENST00000586338 723 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 PAX6-249ENST00000639034 1597 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 DZANK1-201ENST00000262547 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ATXN8OS-201ENST00000414504 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AL354714.2-201ENST00000425270 1097 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AP005901.1-201ENST00000508721 1181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC023078.7-201ENST00000532712 961 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 MIR4725-201ENST00000581700 90 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 FAM86C2P-205ENST00000531806 1814 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SIRT1Q96EB6 TSPAN16-201ENST00000316737 1040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms