Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SCN2BO60939 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SCN2BO60939 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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SCN2BO60939 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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SCN2BO60939 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCN2BO60939 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCN2BO60939 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCN2BO60939 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCN2BO60939 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCN2BO60939 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCN2BO60939 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCN2BO60939 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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