Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 OR13A1-202ENST00000536058 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AGA-201ENST00000264595 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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PTPRJQ12913 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PTPRJQ12913 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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