Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RIPK3-201ENST00000216274 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MYO19-213ENST00000614623 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MRVI1-214ENST00000534266 2824 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE1-209ENST00000552240 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RBMY2FP-201ENST00000303922 2042 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TRPC4-206ENST00000379705 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CTTNBP2-201ENST00000160373 5970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZFAT-201ENST00000377838 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 IKBKE-203ENST00000581977 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC005076.1-201ENST00000433446 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC068338.3-201ENST00000617892 418 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 UNC45B-201ENST00000268876 5679 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ENC1-206ENST00000537006 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN30-202ENST00000420878 4323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 BCAS1-201ENST00000371435 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AOC1-207ENST00000493429 3135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GRM4-201ENST00000374177 3590 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 IKBKB-230ENST00000629753 4069 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MMAA-201ENST00000281317 7068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CLIP3-201ENST00000360535 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TIAM2-212ENST00000529824 5262 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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