Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MAGEA9B-203ENST00000595065 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 IGHV1OR16-2-201ENST00000564937 349 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC140658.2-201ENST00000566360 348 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC074052.1-201ENST00000567734 456 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MIR4527HG-201ENST00000586905 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SULT1A4-201ENST00000360423 1390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RAD9B-202ENST00000392672 1846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SMIM21-201ENST00000382638 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 PGC-204ENST00000425343 1152 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P8-201ENST00000436090 951 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 INO80C-203ENST00000441607 904 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AL669970.2-201ENST00000446184 280 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC245884.7-201ENST00000514037 356 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 IPO7-208ENST00000630083 195 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 TRIT1-201ENST00000316891 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 DCAKD-202ENST00000342350 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 TTLL1-202ENST00000331018 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIRT1Q96EB6 MPDU1-203ENST00000396501 1125 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms