Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 IL1RN-204ENST00000409052 1903 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 GPR119-201ENST00000276218 1008 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC023509.4-201ENST00000602306 775 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms