Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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