| PTPRJ | Q12913 | LINC00910-201 | ENST00000341011 | 2303 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.12 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CAND2-201 | ENST00000295989 | 4429 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.12 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PPP1R32-203 | ENST00000432063 | 1472 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.12 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SCRN1-207 | ENST00000434476 | 1454 nt | TSL 2 BASIC | 14.12 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STAT3-203 | ENST00000404395 | 2633 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.12 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL449403.1-201 | ENST00000432783 | 1577 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.12 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EPB41L2-205 | ENST00000445890 | 3677 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.12 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CASC4-202 | ENST00000345795 | 3764 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IP6K2-221 | ENST00000449610 | 1673 nt | TSL 2 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | THEGL-202 | ENST00000512175 | 1650 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAGI1-201 | ENST00000330909 | 7415 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TBC1D26-201 | ENST00000437605 | 1868 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CBFA2T3-201 | ENST00000268679 | 4477 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SOAT1-203 | ENST00000539888 | 6794 nt | TSL 2 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EIF3CL-201 | ENST00000380876 | 3085 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MME-204 | ENST00000462745 | 3590 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C1orf87-202 | ENST00000450089 | 1307 nt | TSL 5 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IL1R2-202 | ENST00000393414 | 1405 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AAAS-201 | ENST00000209873 | 1840 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IKBKB-218 | ENST00000520835 | 2403 nt | TSL 2 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | OPLAH-204 | ENST00000618853 | 4031 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RPS6KC1-201 | ENST00000366959 | 5454 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DDX31-204 | ENST00000372159 | 4577 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GRIN1-204 | ENST00000371553 | 3751 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TBX4-202 | ENST00000393853 | 3398 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC138969.2-201 | ENST00000532739 | 9932 nt | BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CABP4-201 | ENST00000325656 | 2559 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TOP1MT-213 | ENST00000521193 | 1960 nt | TSL 2 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SIRPA-203 | ENST00000400068 | 4201 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | RSBN1-204 | ENST00000612242 | 6592 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TEPP-201 | ENST00000290871 | 1079 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNF212-201 | ENST00000333673 | 1019 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRPM3-205 | ENST00000361823 | 1260 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AL118511.1-201 | ENST00000439341 | 794 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC083801.1-201 | ENST00000491689 | 358 nt | BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CDK7-211 | ENST00000514676 | 1164 nt | TSL 5 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC023051.2-201 | ENST00000541141 | 460 nt | BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AL022344.2-201 | ENST00000568976 | 968 nt | BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC139099.2-201 | ENST00000572343 | 641 nt | TSL 3 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC009118.3-201 | ENST00000622896 | 873 nt | BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PRKD1-201 | ENST00000331968 | 3726 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZBED2-201 | ENST00000317012 | 2311 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.11 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LLGL1-203 | ENST00000621229 | 3187 nt | TSL 5 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KRT40-201 | ENST00000377755 | 1812 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SUN2-201 | ENST00000405018 | 4022 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KAZN-205 | ENST00000400798 | 3643 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CELF4-201 | ENST00000334919 | 3542 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SUPV3L1-201 | ENST00000359655 | 2484 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MED27-201 | ENST00000292035 | 1431 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | GALT-201 | ENST00000378842 | 1768 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CYP4F12-201 | ENST00000324632 | 1687 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RAB8B-201 | ENST00000321437 | 4943 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ABCB9-201 | ENST00000280560 | 3517 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF706-209 | ENST00000520347 | 3502 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HLA-DQA1-201 | ENST00000343139 | 1591 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM133B-204 | ENST00000445716 | 2026 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FBN3-205 | ENST00000600128 | 9362 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TMEM63C-201 | ENST00000298351 | 5334 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ECI2-201 | ENST00000361538 | 1380 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HLA-DMB-258 | ENST00000418107 | 1397 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARHGEF9-226 | ENST00000636392 | 1920 nt | TSL 5 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UGT1A1-201 | ENST00000305208 | 2382 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IQCF1-201 | ENST00000310914 | 695 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NR2C2AP-201 | ENST00000331552 | 1293 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HDGF-202 | ENST00000368206 | 960 nt | TSL 5 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC096536.3-201 | ENST00000415336 | 575 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NR2C2AP-202 | ENST00000420605 | 859 nt | TSL 2 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | OR7E37P-201 | ENST00000421076 | 897 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CDCA4P4-201 | ENST00000435216 | 680 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PLA2G6-210 | ENST00000435484 | 612 nt | TSL 4 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RPL15-208 | ENST00000435882 | 1063 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC108879.1-201 | ENST00000438026 | 828 nt | TSL 3 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL356000.1-201 | ENST00000441073 | 1238 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC027612.2-202 | ENST00000445955 | 1199 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TULP3P1-202 | ENST00000453253 | 1291 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC104117.1-201 | ENST00000517817 | 900 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IGLVI-63-201 | ENST00000524184 | 384 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP001360.1-203 | ENST00000524708 | 464 nt | TSL 3 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF816-208 | ENST00000535506 | 529 nt | TSL 4 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DDX11L8-201 | ENST00000535849 | 366 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GOLT1B-206 | ENST00000542038 | 933 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GABARAPL1-213 | ENST00000544284 | 531 nt | TSL 3 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL591424.3-201 | ENST00000614278 | 872 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MYOZ3-209 | ENST00000615557 | 1031 nt | TSL 2 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC020904.3-201 | ENST00000624199 | 442 nt | BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC00694-204 | ENST00000637612 | 1059 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GIPR-205 | ENST00000590918 | 3289 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MSRB3-202 | ENST00000355192 | 4289 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.1 | □□□□□ -0.15 | | |