Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 SH3RF2-201ENST00000359120 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC126323.1-203ENST00000562306 2579 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 KCNMB3-203ENST00000392685 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 CLCC1-207ENST00000369976 2468 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 WTAPP1-202ENST00000525739 2642 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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GCAP28676 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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GCAP28676 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCAP28676 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCAP28676 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCAP28676 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 GLDN-210ENST00000612989 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCAP28676 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCAP28676 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCAP28676 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCAP28676 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 MRGPRX2-201ENST00000329773 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCAP28676 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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