Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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