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| PTPRJ | Q12913 | SUCLA2-205 | ENST00000470760 | 1445 nt | TSL 2 BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.14 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VILL-201 | ENST00000283713 | 2970 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SIGLEC12-201 | ENST00000291707 | 2121 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BPIFA4P-201 | ENST00000375465 | 1203 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TMEM95-202 | ENST00000389982 | 1191 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TEDDM2P-201 | ENST00000414169 | 786 nt | BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL391832.2-203 | ENST00000423175 | 554 nt | TSL 3 BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC012506.1-201 | ENST00000423706 | 525 nt | TSL 4 BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HNRNPA1P10-201 | ENST00000444945 | 962 nt | BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL451000.1-201 | ENST00000451300 | 1186 nt | BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | DMKN-256 | ENST00000492341 | 738 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IGHEP2-201 | ENST00000519308 | 1256 nt | BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC109597.2-201 | ENST00000569407 | 927 nt | TSL 3 BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC018766.1-201 | ENST00000601211 | 484 nt | TSL 3 BASIC | 14.15 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | COL6A1-201 | ENST00000361866 | 4238 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ACVR1B-202 | ENST00000415850 | 1665 nt | TSL 2 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HSPA4-204 | ENST00000615899 | 2204 nt | TSL 5 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SPPL2A-201 | ENST00000261854 | 7372 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZP4-201 | ENST00000366570 | 1799 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC4A7-207 | ENST00000437179 | 3667 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ELOVL1-216 | ENST00000621943 | 1625 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PSMC1-201 | ENST00000261303 | 4448 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CYP2B7P-201 | ENST00000541697 | 1476 nt | BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MEFV-209 | ENST00000541159 | 1888 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SQSTM1-201 | ENST00000360718 | 2253 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC004899.2-201 | ENST00000622993 | 3860 nt | BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM156B-201 | ENST00000416841 | 2537 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TFG-202 | ENST00000418917 | 1716 nt | APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SERPINB1-201 | ENST00000380739 | 2619 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR22HG-208 | ENST00000574306 | 2626 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LNP1-201 | ENST00000383693 | 2210 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PMP22-203 | ENST00000395938 | 1817 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MDM1-204 | ENST00000411698 | 2472 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RAB6A-201 | ENST00000310653 | 3389 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TONSL-201 | ENST00000409379 | 4502 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NR3C1-204 | ENST00000394466 | 3245 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | TSFM-204 | ENST00000454289 | 2192 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KRTAP6-1-201 | ENST00000329122 | 500 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PILRA-205 | ENST00000453419 | 1043 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC233724.9-201 | ENST00000511694 | 407 nt | BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AL590094.1-206 | ENST00000635959 | 478 nt | TSL 5 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL590094.1-209 | ENST00000637260 | 499 nt | TSL 5 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NR4A1-201 | ENST00000243050 | 2678 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF215-207 | ENST00000610573 | 1503 nt | TSL 5 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAGED2-205 | ENST00000375060 | 1798 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LILRB4-205 | ENST00000430952 | 1761 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.14 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL359643.2-201 | ENST00000606227 | 3273 nt | TSL 2 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BAIAP2-202 | ENST00000321300 | 2879 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNF113A-201 | ENST00000371442 | 1353 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | YAP1P1-201 | ENST00000401504 | 1393 nt | BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FHL2-208 | ENST00000409807 | 1601 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DDX11L2-201 | ENST00000437401 | 1398 nt | BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AGAP3-226 | ENST00000622464 | 3121 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SH3KBP1-205 | ENST00000397821 | 4731 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HAGLR-202 | ENST00000416928 | 4235 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FSTL4-201 | ENST00000265342 | 5419 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DHX30-215 | ENST00000619982 | 3574 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SNAP25-202 | ENST00000304886 | 2050 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MYT1-202 | ENST00000360149 | 2061 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CSNK1G3-201 | ENST00000345990 | 4635 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PYGL-206 | ENST00000544180 | 2696 nt | TSL 2 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PSMC5-201 | ENST00000310144 | 1579 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TACC1-209 | ENST00000520611 | 1550 nt | TSL 2 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LYPLA1-202 | ENST00000343231 | 1308 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TNFSF8-201 | ENST00000223795 | 1906 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CYP20A1-201 | ENST00000356079 | 1949 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DDX19B-213 | ENST00000568625 | 1681 nt | TSL 2 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MKX-201 | ENST00000375790 | 3846 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AXL-202 | ENST00000359092 | 3206 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PRKCH-201 | ENST00000332981 | 3582 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LPGAT1-201 | ENST00000366996 | 2035 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TMEM189-202 | ENST00000371652 | 7714 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF200-205 | ENST00000431561 | 3348 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ITGAL-203 | ENST00000433423 | 1416 nt | TSL 2 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KRT40-202 | ENST00000398486 | 1772 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PTPN13-203 | ENST00000427191 | 8487 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | COQ5-201 | ENST00000288532 | 1535 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAGEB1-201 | ENST00000378981 | 1866 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ABLIM2-206 | ENST00000447017 | 2902 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MN1-201 | ENST00000302326 | 7556 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PTK2-202 | ENST00000395218 | 4415 nt | TSL 5 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC005549.1-201 | ENST00000579438 | 1629 nt | BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HIPK3-201 | ENST00000303296 | 7408 nt | TSL 5 BASIC | 14.13 | □□□□□ -0.15 | | |