Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPRJQ12913 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRJQ12913 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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