Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms