Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SMARCAL1-201ENST00000357276 3271 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL118508.3-201ENST00000623468 1854 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PRDM7-202ENST00000449207 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RNF13-203ENST00000392894 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LILRA4-201ENST00000291759 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC008966.1-201ENST00000502171 2367 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PTPRD-AS2-201ENST00000429581 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF7-202ENST00000336237 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AC245884.11-201ENST00000616950 1734 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MPP4-208ENST00000447335 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 AL121772.1-201ENST00000618303 2335 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HMGB1P1B2RPK0 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms