Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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