Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
U3KQE9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U3KQE9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
U3KQE9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U3KQE9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U3KQE9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
U3KQE9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
U3KQE9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U3KQE9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms