Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP15Q9Y4E8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP15Q9Y4E8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms