Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q9Y3F1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9Y3F1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms