Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC4Q9Y296 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms