Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2BQ9UQN3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2BQ9UQN3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms